针对 SARS-CoV-2 和 SARS-CoV 的刺突表面糖蛋白的姜黄素及其类似物的虚拟筛选。
摘要来源:J Biomol 结构动态。 2021 年 1 月 5:1-9。 Epub 2021 年 1 月 5 日。PMID:33397223
摘要作者:Ashish Patel、Malathi Rajendran、Ashish Shah、Harnisha Patel、Suresh B Pakala、Prashanthi Karyala
文章隶属关系:Ashish Patel
摘要:COVID-19 是一种由 SARS-CoV-2 引起的新流行病,于 2019 年在中国武汉首次发现。新型冠状病毒 SARS-CoV-2 和 2002 年 SARS-CoV 有 74% 的同一性,并使用相似的机制进入细胞。两种病毒通过病毒刺突糖蛋白与宿主受体结合、血管紧张素转化进入宿主细胞。酶 2 (ACE2)。靶向病毒的进入比抑制病毒生命周期的后期具有更好的优势。 SARS-CoV(6CRV:全长 S 蛋白)和 SARS-CoV-2 Spike 蛋白(6M0J:受体结合域,RBD)的晶体结构用于确定潜在的小分子抑制剂。姜黄素是一种天然存在的植物化学物质,已知具有广泛的药理学特性。在本研究中,使用 Autodock 4.2 将姜黄素及其衍生物对接到 6CRV 和 6M0J 上,以研究它们作为刺突蛋白抑制剂的能力,从而研究病毒进入的能力。姜黄素及其衍生物的结合能ΔG范围为-10.98至-5.12kcal/mol (6CRV)和-10.01至-5.33kcal/mol (6M0J)。双去甲氧基姜黄素的结合能最小:ΔG = -10.98kcal/mol (6CRV) 和 -10.01kcal/mol (6M0J)。良好的结合能、药物相似性和有效的药代动力学参数表明姜黄素的潜力及其少数衍生物作为 SARS-CoV-2 刺突蛋白抑制剂。然而,还需要进一步研究来调查这些化合物作为病毒进入抑制剂的能力。由 Ramaswamy H. Sarma 传达。