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探索选定类黄酮潜在抗基孔肯雅热活性的计算方法。
摘要来源：Sci Rep. 2016 ;6:24027。 Epub 2016 年 4 月 13 日。PMID：27071308
摘要作者：Seyedeh Somayeh Seyedi、Munirah Shukri、Pouya Hassandarvish、Adrian Oo、Shankar Esaki Muthu、Sazaly Abubakar、Keivan Zandi
文章隶属关系：Seyedeh Somayeh Seyedi
p>摘要：基孔肯雅病毒（CHIKV）是一种蚊媒甲病毒，可引起人类基孔肯雅病毒感染。尽管 CHIKV 广泛分布，但尚无针对该病毒的抗病毒药物或疫苗。因此，寻找有效的化合物来对抗CHIKV至关重要。我们的目的是预测两者之间可能的相互作用使用计算方法发现 CHIKV 的非结构蛋白 3 (nsP) 是 CHIKV 细胞内复制中最重要的病毒元件之一，以及 3 种潜在的黄酮类化合物。从蛋白质数据库检索 nsP3 的 3 维结构，使用 AutoDock Vina 制备并与黄芩苷、柚皮素和槲皮素作为配体对接。根据最小结合能确定对目标蛋白具有最强结合亲和力的一级配体。进行进一步分析以确定与测试配体反应的蛋白质的活性位点以及所有现有的分子间键。与其他配体相比，黄芩苷具有最佳的结合亲和力（-9.8kcal/mol），被认为是最有潜力的病毒活性抑制剂。黄芩苷可以被认为是进一步评估的良好候选者，作为一种潜在有效的 CHIKV 抗病毒药物。