青藤碱通过抑制MMP9和炎症细胞因子表达治疗类风湿性关节炎：生物信息学分析与实验验证。
摘要来源：Sci Rep. 2024 Jun 4；14(1)：12786。 Epub 2024 年 6 月 4 日。PMID：38834626
摘要作者：罗金芳、朱毅、于阳、陈玉杰、何康、刘建新
文章所属单位：罗金芳
摘要：类风湿性关节炎（RA）是一种慢性全身性自身免疫性疾病，以炎症细胞浸润和关节损伤为特征。中国政府已批准处方药青藤碱（SIN），一种有效的抗炎药物，用于治疗类风湿性关节炎。本研究基于生物信息学评估了 SIN 在 RA 中可能的抗炎作用语言学分析和实验。从基因表达综合（GEO）数据库中获取了六个微阵列数据集。我们使用 R 软件来识别差异表达基因 (DEG) 并进行功能评估。使用 CIBERSORT 计算 22 个浸润免疫细胞的丰度。加权基因共表达网络分析 (WGCNA) 用于发现与 M1 巨噬细胞相关的基因。使用四个公共数据集来预测 SIN 的基因。随后，对 hub 基因进行功能富集分析。采用 cytoHubba 和最小绝对收缩和选择算子（LASSO）来选择中心基因，并使用接受者算子特征（ROC）曲线预测其诊断效果。进行分子对接以确认 SIN 和 hub 基因之间的亲和力。此外，使用蛋白质印迹和酶联免疫吸附在 LPS 诱导的 RAW264.7 细胞系中验证了 SIN 的治疗效果耳鼻喉科测定（ELISA）。通过生物信息学分析和分子对接，基质金属蛋白酶 9 (MMP9) 被确定为 RA 中与 M1 巨噬细胞相关的中枢生物标志物。我们的研究表明 MMP9 参与 IL-17 和 TNF 信号通路。此外，我们发现 SIN 抑制 LPS 诱导的 RAW264.7 细胞系中 MMP9 蛋白的过表达和促炎细胞因子，包括肿瘤坏死因子-α (TNF-α) 和白细胞介素 6 (IL-6)。总之，我们的工作为 RA 的病理生理学提供了新的线索，并将 MMP9 确定为可能的 RA 关键基因。总之，上述研究结果表明，从新兴研究的角度来看，SIN 可能是治疗 RA 的一种潜在的、经济有效的抗炎药物。