[基于网络药理学和生物信息学的天然虾青素抗肾透明细胞癌的治疗机制]。
摘要来源：南方医科大学学报。 2021 年 12 月 20 日；41(12):1763-1772。 PMID：35012906
摘要作者：高杰、杨德、曹荣、潘X、夏杰
文章所属单位：高杰
摘要：目的：基于网络药理学和生物信息学探讨天然虾青素（AST）抑制肾透明细胞癌（KIRC）的分子机制。
方法：利用PharmMapper数据库检索天然虾青素的靶标，利用TCGA数据库识别KIRC及癌旁组织中的差异表达基因（DEG）。使用Cytoscape软件分析AST的靶基因构建“药物-靶标"网络图。利用String数据库构建视觉蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络，并对核心靶标进行GO富集分析。通过单基因生物信息学验证筛选出的AST核心靶点，即胎盘生长因子（PGF）。采用CCK-8法检测天然AST对KIRC细胞活力的影响，并利用分子对接技术评估天然AST与PGF的结合。采用 RT-qPCR 和 Western blotting 分析天然 AST 对靶基因 mRNA 和蛋白表达的影响。
结果： 我们确定了 278 个 AST 候选靶点、1081 个 KIRC 相关靶点以及 7 个涉及 AST 抗 KIRC 治疗机制的核心靶点。在这 7 个核心靶标中，PGF 在 KIRC 中的表达显着上调（<0.001），与不良预后相关（HR=1.37，=0.043）。分子对接显示AST与PGF的结合能为-5.43 kcal/mol。 CCK-8检测显示50μmol/L浓度的AST能够抑制KIRC细胞的增殖，且浓度越高抑制作用越强。 RT-qPCR和Western blotting结果显示，AST处理显着降低了KIRC细胞中PGF mRNA和蛋白水平的表达。
结论：天然AST可以抑制KIRC的增殖，抑制细胞内PGF的表达。