鉴定茶树中作为 SARS-CoV-2 主要蛋白酶抑制剂的生物活性分子。
摘要来源:J Biomol Struct Dyn。 2020 年 5 月 20:1-10。 Epub 2020 年 5 月 20 日。PMID:32397940
摘要作者:Vijay Kumar Bhardwaj、Rahul Singh、Jatin Sharma、Vidya Rajendran、Rituraj Purohit、Sanjay Kumar
文章隶属关系:Vijay Kumar Bhardwaj
摘要:SARS-CoV-2 是导致全球卫生紧急情况的 COVID-19 大流行的病原体。缺乏针对性的治疗方法和有限的治疗选择促使科学界针对 SARS-CoV-2 的各种靶点开发新的疫苗或小分子疗法。主要蛋白酶 (Mpro) 具有良好的特性和吸引力活性药物靶点,因为它在病毒复制所需的多蛋白加工中发挥着至关重要的作用。为了提供针对 Mpro 的潜在先导分子用于临床,我们对接了一组 65 个茶树生物活性分子,然后通过长期分子动力学 (MD) 模拟(1.50 μs)探索蛋白质-配体复合物的广阔构象空间)。通过将其与针对 SARS-CoV-2 的再利用药物(阿扎那韦、达芦那韦和洛匹那韦)的对接分数进行比较,选择了前三种生物活性分子(Oolonghomobisflavan-A、Theasinensin-D 和 Theaflavin-3-O-gallate)。与所有三种重新利用的药物分子相比,Oolonghomobisflavan-A 分子显示出与 Mpro 的大量氢键和更高的 MM-PBSA 结合能。在模拟的时候。这项研究表明 Oolonghomobisflavan-A 是一种潜在的生物活性分子,可作为 SARS-CoV-2 Mpro 的抑制剂。 [公式:见正文]Ramaswamy H.S 通讯武装。