新生儿 DNA 甲基化和孕期母亲吸烟：全基因组联合荟萃分析。
摘要来源：Am J哼哼热内特。 2016 年 4 月 7 日；98(4):680-96。 Epub 2016 年 3 月 31 日。PMID：27040690
摘要作者：Bonnie R Joubert、Janine F Felix、Paul Yousefi、Kelly M Bakulski、Allan C Just
文章隶属关系：Bonnie R Joubert
摘要：表观遗传修饰，包括 DNA 甲基化，代表了环境影响人类疾病的潜在机制。母亲在怀孕期间吸烟仍然是一个重要的公共卫生问题，它以多种方式影响儿童健康，并可能产生终生后果。其机制在很大程度上尚不清楚，但表观遗传学很可能发挥了作用e.我们成立了妊娠和儿童表观遗传学 (PACE) 联盟，并使用 Illumina 450K 对 13 个队列 (n = 6,685) 进行了荟萃分析，了解孕期母亲吸烟与超过 450,000 个 CpG 位点 (CpG) 的新生儿血液 DNA 甲基化之间的关联珠片。超过 6,000 个 CpG 与母亲吸烟相关，具有全基因组统计显着性的差异甲基化（错误发现率，5%），其中 2,965 个 CpG 对应于 2,017 个先前与新生儿或成人吸烟和甲基化无关的基因。一些基因与母亲吸烟（例如口面部裂和哮喘）或成人吸烟（例如某些癌症）引起的疾病有关。许多差异甲基化的 CpG 与基因表达相关。我们观察到对发展至关重要的途径和过程的丰富。在年龄较大的儿童中（5 个队列，n = 3,187），100% 的 CpG 至少给出名义上的显着性水平，远远超出偶然预期（p 值 <2.2 × 10(-16)）。结果对于研究和细胞类型调整中使用的不同标准化方法是稳健的。在这项对甲基化数据的大规模荟萃分析中，我们确定了许多与怀孕期间母亲吸烟反应相关的位点，并持续到儿童后期，并提供了对这种重要暴露影响的潜在机制的见解。