计算和见解之间丹参酮 IIA、鼠尾草酸、迷迭香酸、丹酚酸、黄芩素和甘草次酸的抗 SARS-CoV-2 活性。
摘要来源：RSC 高级。 2021 年 9 月 1 日；11(47):29267-29286。 Epub 2021 年 9 月 1 日。PMID：35492070
摘要作者：Dalia Elebeedy、Walid F Elkhatib、Ahmed Kandeil、Aml Ghanem、Omnia Kutkat、Radwan Alnajjar、Marwa A Saleh、Ahmed I Abd El Maksoud、Ingy Badawy、Ahmed A Al-Karmalawy
文章归属：Dalia Elebeedy
摘要：六种化合物，即丹参酮 IIA (1)、鼠尾草酸 (2)、迷迭香酸 (3)、丹酚酸 B (4)、筛选了黄芩素 (5) 和甘草次酸 (6) 的抗 SARS-CoV-2 活性(S) 和主要蛋白酶 (Mpro) 受体使用分子对接研究。分子对接表明丹酚酸 B (4) 和甘草次酸 (6) 均具有优异的亲和力，这是之前发表的计算文章的共同结果。另一方面，在 Vero E6 细胞上使用 MTT 测定测量其 CC 值后，使用空斑减少测定来测试它们的实际抗 SARS-CoV-2 活性，以计算它们的 IC 值。令人惊讶的是，丹参酮 IIA (1) 是最有前途的成员，IC 值为 4.08 ngμl。此外，鼠尾草酸 (2) 和迷迭香酸 (3) 均显示出良好的 IC 值，分别为 15.37 和 25.47 ngμl。然而，丹酚酸 (4) 显示出较弱的抗 SARS-CoV-2 活性，IC 值为 58.29 ngμl。此外，从计算的角度来看，对最活跃的化合物（丹酚酸 4）进行了 100 ns 的分子动力学模拟，此外，对 S 和 S 上最活跃的生物活性化合物（丹参酮 IIA 1）进行了Mpro 复合物（四种不同的分子动力学过程），以确认对接结果，并分别提供有关 SARS-CoV-2 受体内两种化合物稳定性的更多见解。此外，为了了解受测化合物抑制 SARS-CoV-2 的作用机制，有必要检查最有前景的两种化合物丹参酮 IIA (1) 和鼠尾草酸 (2) 的作用方式。两种化合物（1和2）都显示出非常有前途的杀病毒活性，最显着的是对病毒吸附而不是其复制的抑制作用。这表明这两种化合物针对 SARS-CoV-2 的 S 蛋白而不是 Mpro 蛋白的预测活性。我们的结果非常有希望根据前面提到的化合物对 SARS-CoV-2 的实际抑制活性进行重新排列，并寻找它们对 SARS-CoV-2 的作用和结果之间巨大差异背后的原因。最后，我们推荐d 进一步推进临床前和临床研究，特别是丹参酮 IIA (1) 单独或与鼠尾草酸 (2)、迷迭香酸 (3) 和/或丹酚酸 (4) 联合快速应用于 COVID-19 管理。