虫草素作为 SARS-CoV-2 RNA 依赖性 RNA 聚合酶 (RdRp) 的有前景的抑制剂。
摘要来源:Curr Med Chem。 2021 年 8 月 20 日。Epub 2021 年 8 月 20 日。PMID:34420502
摘要作者:Shabana Bibi、Mohammad Mehedi Hasan、王远兵、Stavros P Papadakos、洪宇
文章隶属关系:Shabana Bibi
摘要:背景:在中国武汉出现的 SARS-CoV-2 是一种新的全球威胁,已导致数百万人死亡并将继续这样做。这场大流行不仅威胁着人类的生命,还引发了世界各地的经济衰退。研究人员在发现 SARS-CoV-2 发病机制的分子见解和开发疫苗方面取得了重大进展,但仍然没有成功治愈 SARS-CoV-2 感染患者。
OBJECTIVE:本研究提出了一种药物重新定位流程,用于设计和发现有效的真菌衍生生物活性代谢物作为抗 SARS-CoV-2 的候选药物。
方法:本研究选择真菌衍生物“虫草素"来研究其对 RNA 依赖性 RNA 聚合酶 (RdRp) 的抑制特性(PDB ID:6M71) )的 SARS-CoV-2。利用化学信息学方法测定了化合物的药理学特征、分子间相互作用、结合能和稳定性。随后进行分子动力学模拟,以更好地了解虫草素与RdRp的结合机制。
结果:药理数据和检索到的分子动力学模拟轨迹表明虫草素具有优异的药物似性和更高的结构稳定性,而催化残基(Asp760、Asp761)以及 RdRp 的其他活性位点残基(Trp617、Asp618、Tyr619、Trp800、Glu811)在整个模拟范围内表现出更好的稳定性。
结论:药理学研究和分子模拟的良好结果表明,虫草素对 SARS-CoV-2 聚合酶 (RdRp) 表现出强大的抑制潜力。因此,强烈建议在实验室测试虫草素,以确认其对 SARS-CoV-2 聚合酶(RdRp)的抑制潜力。