计算研究揭示醌衍生物抑制 SARS-CoV-2 的机制。对 Embelin 和两种感兴趣的治疗化合物甲基泼尼松龙和地塞米松的研究。
摘要来源：J Infect Public Health。 2020 年 10 月 14 日。Epub 2020 年 10 月 14 日。PMID：33109497
摘要作者：Francesco Caruso、Miriam Rossi、Jens Z Pedersen、Sandra Incerpi
文章隶属关系：Francesco Caruso
摘要：
背景：醌类与含有半胱氨酸残基的蛋白质有反应，Covid-19 中的主要蛋白酶含有一个包括 Cys145 的活性位点。 Embelin 是一种醌类天然产物，已知具有针对流感和流感病毒的抗病毒活性。乙型肝炎。我们组的初步研究也表明其能够抑制培养细胞中的HSV-1。
方法：对接和 DFT 方法应用于蛋白酶靶标。
结果：抑制 SARS-CoV-2 Mpro 的机制描述了蛋白酶，特别是由于 S(Cys145) 和 embelin C(羰基) 之间形成共价键。这得益于两个蛋白质氨基酸 (1) N(咪唑-His41)，它能够捕获 H[S(Cys145)] 和 (2) HN(His163)，它向嵌入素 O(羰基) 提供一个质子，形成一个导致病毒蛋白酶抑制的 OH 部分。用于治疗 Covid-19 患者的抗炎药物甲基泼尼松龙和地塞米松也出现了类似的过程。甲基泼尼松龙和地塞米松是甲基醌，仅具有一个羰基部分，而安贝林则具有两个羰基部分。额外的考虑因素是给予另一种天然产物大黄素（最近获得针对 Covid-19 的专利），以及一些治疗性醌、维生素 K（疑似参与 Covid-19 作用）和辅酶 Q10。所有结果都显示出与 embelin、地塞米松和甲基泼尼松龙结果相似的结构。
结论：我们关于 embelin 和相关醌类的数据表明：这些天然化合物可能是对抗 Covid-19 的可行战略工具。