揭开自然果篮的面纱，通过计算将柑橘 csi-mir169-3p 识别为针对参考和 Omicron SARS-CoV-2 基因组的可能植物 miRNA。
摘要资料来源：Comput Biol Med。 2022 年 7 月；146:105502。 Epub 2022 年 4 月 8 日。PMID：35605482
摘要作者：Naman Mangukia、Priyashi Rao、Kamlesh Patel、Himanshu Pandya、Rakesh M Rawal
文章隶属关系：Naman Mangukia
摘要：The长期以来，microRNA (miRNA) 的基本作用一直与通过 RNA 干扰机制在 mRNA 3UTR 转录和转录后调节基因表达有关。此外，miRNA 如何诱导 mRNA 降解的过程已在许多感染性疾病中得到主要研究。疾病。在本文中，我们想讨论源自新鲜水果的膳食植物 miRNA 与 COVID-19 病原体病毒基因组的相互作用，特别是针对 SARS-CoV-2（严重急性呼吸综合征冠状病毒 2）的 3UTR基因组。扩大分析范围后，我们还发现了与全球 37 个国家/地区的 SARS-CoV-2 的 Omicron (B.1.1.529) 变体相互作用的植物 miRNA。这种跨物种的病毒与植物的相互作用使我们确定了在柑橘（橙子）、桃子（桃子）、葡萄（葡萄）和苹果（苹果）等水果中发现的膳食植物 miRNA 与病毒基因组的比对。特别值得关注的是中华细线虫 miRNA - csi-miR169-3p 和 SARS-CoV-2 的相互作用，因为目标 3UTR 区域“CTGCCT"在全球所有精选的 772 个 Omicron 变体中被发现是保守的。因此，这个位点“CTGCCT"和 miRNA csi-miR169-3p 可能会成为有希望的诱导病毒基因组沉默的油菜候选者。因此，这项研究揭示了水果如何对抗 SARS-CoV-2 等病毒并帮助维持个体强大的免疫系统的机制。