植物源性天然多酚作为潜在抗病毒药物对抗 SARS-CoV-2RNA 依赖性 RNA 聚合酶 (RdRp) 抑制：分析。
摘要来源：J Biomol Struct Dyn。 2020 年 7 月 28:1-16。 Epub 2020 年 7 月 28 日。PMID：32720577
摘要作者：Satyam Singh、Md Fulbabu Sk、Avinash Sonawane、Parimal Kar、Sushabhan Sadhukhan
文章隶属关系：Satyam Singh
摘要：The由严重急性呼吸系统综合症冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 引起的冠状病毒病 (COVID-19) 突然爆发，对全球公共卫生构成巨大威胁。现在，尚无治疗药物或疫苗可治疗 COVID-19。由于新药开发过程耗时，药物重新利用可能是应对 COVID-19 的唯一可行解决方案。 RNA 依赖性 RNA 聚合酶 (RdRp) 催化 SARS-CoV-2 RNA 复制，因此是抗病毒药物设计的明显目标。有趣的是，几种植物来源的多酚可以有效抑制其他 RNA 病毒的 RdRp。更重要的是，多酚长期以来一直被用作膳食补充剂，并在免疫稳态中发挥有益作用。我们很想研究多酚与 SARS-CoV-2 RdRp 的结合，并评估它们治疗 COVID-19 的潜力。在这里，我们建立了一个多酚库，这些多酚对各种疾病都显示出显着的治疗效果。它们成功对接在 RdRp 的催化口袋中。研究表明，EGCG、茶黄素 (TF1)、茶黄素-3-没食子酸酯 (TF2a)、茶黄素-3-没食子酸酯 (TF2b)、茶黄素 3,3-二没食子酸酯 (TF3)、橙皮苷、槲皮素和杨梅素与 RdRp 的活性位点强烈结合。此外，150 ns 分子动力学模拟显示 EGCG、TF2a、TF2b、TF3 与 RdRp 形成高度稳定的结合构象。 MM-PBSA 计算的结合自由能分量也证实了复合物的稳定性。我们还对其成药性的 ADME 预测、毒性预测和靶点分析进行了详细分析。总的来说，我们的结果表明 EGCG、TF2a、TF2b、TF3 可以抑制 RdRp，是治疗 COVID-19 的有效方法。由 Ramaswamy H. Sarma 传达。