下一代测序揭示了表没食子儿茶素-3-没食子酸酯在调节非小细胞肺癌 A549 细胞中针对 MAPK 通路的假定新型和已知 microRNA 中的作用.
摘要来源：分子。 2019 年 1 月 21 日；24(2)。 Epub 2019 年 1 月 21 日。PMID：30669618
摘要作者：Vaishali Bhardwaj、Abul Kalam Azad Mandal
文章所属单位：Vaishali Bhardwaj
摘要：肺癌占非小细胞肺癌的 85%细胞肺癌确诊病例。 MicroRNA 是能够调节多种致癌途径的新型生物标志物。表没食子儿茶素-3-没食子酸酯 (EGCG) 是一种有效的癌症化学预防和化疗剂。我们的目的是鉴定重要的已知和推定的新型 microRNA使用新一代测序技术在 A549 细胞中通过 EGCG 进行调节，并鉴定其基因靶点。初步分析显示，40 μM EGCG 处理时，IC50 值为 309μM，G0/G1 期停滞。 MicroRNA 分析在 40μM EGCG 处理的 A549 细胞中鉴定出 115 种已知的 microRNA 和 4 种假定的新型 microRNA，以及在 100μM EGCG 处理的 A549 细胞中鉴定出 134 种已知的和 3 种假定的新型 microRNA。未处理的对照细胞和经 EGCG 处理的 A549 细胞中前 10 个上调表达的 microRNA 相似。在未经处理的对照和经 EGCG 处理的 A549 细胞中观察到致癌 microRNA 的表达上调，这些 microRNA 属于广泛保守的种子家族。京都基因和基因组百科全书以及通过进化关系进行蛋白质分析对经过验证的 microRNA 靶向基因的通路分析强化了这样的假设：EGCG 治疗可以调节在 MAPK 信号通路中发挥重要作用的 microRNA。通过随机选择的实时定量 PCR 验证 microRNA 的表达谱d 微小RNA。这项研究确定了特征性 microRNA，可用作肺癌诊断的新型生物标志物。