甲型流感病毒(a/Puerto Rico/8/1934 H1N1 株)的抗病毒化合物筛选、肽设计和蛋白网络构建。
摘要来源:Drug Dev Res 。 2018 年 10 月 1 日。Epub 2018 年 10 月 1 日。PMID:30276835
摘要作者:Surovi Saikia、Manobjyoti Bordoloi、Rajeev Sarmah、Bhaskor Kolita
文章归属:Surovi Saikia
摘要:点击, Lead&Candidate Discovery 基于植物的抗病毒治疗是当前整体医疗保健管理的需求,可以通过植物化学物质的筛选和抗病毒肽的设计来实现。存在某些直接参与病毒快速复制导致全球大流行的宿主因素。总共 177 种植物化学物质,来自圣罗勒 (Ocimum sainttum (L.))、心叶青牛胆 (Tinospora cordifolia (Thunb.) Miers)、樟树 (Cinnamomum camphora (L.) J. Presl.)、葱 (L.)、姜黄 (L.) 和芦荟 (L.)L.) 布尔姆。 f.评估了它们对所有 H1N1 病毒蛋白的亲和力。应用药物过滤器并保持此类过滤器相对于标准的阈值,发现 82 种化合物适合进一步分析。采用共识评分系统从82个化合物中筛选出顶级配体,筛选出排名前12的化合物。筛选出亲水性、柔性、抗原性且带电荷的高度保守区域(>80%)作为有效的抗病毒肽。将病毒蛋白作为蛋白质-蛋白质对接建模肽的靶标。此外,构建宿主-病原体相互作用网络以揭示参与病毒复制的宿主因子,通过与通路数据库的映射从中选择代表其参与病毒复制的独特蛋白质簇。研究发现 12 种化合物和 5 种肽对 H1N1 流感的所有蛋白质都非常有效。基于独特性,获得了13个蛋白质簇d 参与细胞过程,即病毒繁殖、6-磷酸果糖代谢、氮化合物代谢、生物合成、细胞过程、少突胶质细胞发育、定位、多生物体过程、初级代谢、对未折叠蛋白的反应、代谢和对蛋白质和分解代谢。