基于网络药理学和分子对接的甲型流感治疗机制。
摘要来源：Ann Transl Med。 2022 年 3 月；10(6):351。 PMID：35433930
摘要作者：李庆、刘云涛、杨敏、金连顺、吴雅丽、唐丽娟、何刘云、吴定红、张忠德
文章归属：李庆
摘要：背景：（RS）在中国用于治疗流感已有数千年的历史。然而，其作用机制仍不清楚。本研究旨在利用网络药理学和分子对接的方法探索RS治疗甲型流感的活性成分和潜在的分子机制。
方法：通过访问网络数据库获得RS和甲型流感的靶基因。然后，我们使用 R 和 Perl 语言通过生物信息学确定了两个基因的交叉点。蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络由STRING网站（https://cn.string-db.org）构建。使用 Cytoscape 软件进行网络分析。上述基因应用基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)。以交互为先的条件，筛选出作为核心目标的有效组件。这些核心靶标与甲型流感病毒主要RNA编码蛋白的3D结构相结合。分子对接用于通过 AutoDock Vina 和 PyMOL 可视化药物与靶标的相互作用。
结果：28 个活性成分和通过活性成分调控网络获得40个靶基因RS 和 PPI 网络的费用。通过GO富集分析获得71个生物信息学表达（P<0.05）。 KEGG富集分析共筛选出124条信号通路（P<0.05）。富含RS的金合欢素、汉黄芩素、黄芩素、木木素A、β-谷甾醇与血凝素(HA)、神经氨酶(NA)、核蛋白(NP)、聚合酶碱性蛋白1(PB1)、聚合酶碱性蛋白密切相关2（PB2）、聚合酶酸性（PA）、基质蛋白1（M1）、基质蛋白2（M2）和非结构蛋白（NS）是甲型流感病毒的主要RNA编码蛋白。这8个蛋白的结合能均小于-5 kJ/mol，表明配体与受体蛋白具有较强的亲和力。
结论：RS富含核心目标化合物，作用机制进一步表达。通过多种化合物、多种成分对甲型流感有良好的治疗效果。对这些特定的蛋白质靶点以及与免疫和炎症相关的靶点和通路进行靶向调控。