甲型流感病毒（a/Puerto Rico/8/1934 H1N1 株）的抗病毒化合物筛选、肽设计和蛋白网络构建。
摘要来源：Drug Dev Res 。 2018 年 10 月 1 日。Epub 2018 年 10 月 1 日。PMID：30276835
摘要作者：Surovi Saikia、Manobjyoti Bordoloi、Rajeev Sarmah, Bhaskor Kolita
文章归属：Surovi Saikia
摘要：热门、领先和候选发现基于植物的抗病毒疗法是当前整体医疗保健管理的需求，可以通过筛选来实现植物化学物质的研究和抗病毒肽的设计。存在某些宿主因素直接参与病毒快速复制，导致全球大流行。总共 177 种植物化学物质，来自圣罗勒 (Ocimum sainttum (L.))、心叶青牛胆 (Tinospora cordifolia (Thunb.) Miers)、樟树 (Cinnamomum camphora (L.) J. Presl.)、葱 (L.)、姜黄 (L.) 和芦荟 (Aloe ver)a (L.) Burm。 f.评估了它们与 H1N1 所有病毒蛋白的亲和力。应用药物过滤器并保持此类过滤器相对于标准的阈值，发现 82 种化合物适合进一步分析。采用共识评分系统从82个化合物中筛选出顶级配体，筛选出排名前12的化合物。筛选出亲水性、柔性、抗原性且带电荷的高度保守区域（>80%）作为有效的抗病毒肽。将病毒蛋白作为蛋白质-蛋白质对接建模肽的靶标。此外，构建宿主-病原体相互作用网络以揭示参与病毒复制的宿主因子，通过与通路数据库作图，从中选择代表其参与病毒复制的独特蛋白质簇。研究发现 12 种化合物和 5 种肽对 H1N1 流感的所有蛋白质都非常有效。基于其独特性，获得了13个蛋白质簇参与细胞过程，即病毒繁殖、果糖6-磷酸代谢、氮化合物代谢、生物合成、细胞过程、少突胶质细胞发育、定位、多生物体过程、初级代谢、对未折叠蛋白的反应、代谢和对蛋白质和分解代谢。