摘要标题：
乙型肝炎病毒 X 蛋白作为治疗靶点的计算机分子研究。
摘要来源：J Biomol Struct Dyn。 2023 年 5 月 30:1-14。 Epub 2023 年 5 月 30 日。PMID：37254310
摘要作者：Yassir Hamadalnil、Hisham N Altayb
文章隶属关系：Yassir Hamadalnil
摘要：乙型肝炎病毒是肝硬化和肝细胞癌的主要原因。 HBx 病毒蛋白被认为是发病机制和肝癌发生的一个贡献者。本研究旨在筛选一些抗病毒化合物针对 HBx 蛋白的作用，以抑制其功能。在这里，应用分子对接、分子动力学模拟、MM/GBSA 和 T-SNE 方法来研究复合物稳定性并对模拟中生成的构象进行聚类。在本研究筛选的 179 种化合物中，三种抗病毒药物（SC75741、安石榴苷、和 Ledipasvir）表现出最低的对接能量和最好的相互作用。在这些化合物中，SC75741被确定为HBx的有效抑制剂，在分子动力学模拟过程中表现出最佳和最稳定的相互作用，并阻断与细胞侵袭相关的HBx螺旋残基（aa 88-100）附近的区域。通过MM/GBSA进行分子动力学模拟结果的相对结合自由能分析显示，SC75741的结合能为-9.9kcal/mol，安石榴苷的结合能为-11kcal/mol，雷迪帕韦的结合能为-10.1kcal/mol。这些结果阐明了这些化合物在针对 HBx 的研究中的可能用途。由 Ramaswamy H. Sarma 传达。