人参皂苷Rg3对糖尿病肾病的基因组表达谱和生物信息学分析。
摘要来源：Mol Med Rep. 2016 年 8 月；14(2):1162-72。 Epub 2016 年 5 月 27 日。PMID：27279428
摘要作者：王娟、崔春丽、李富、肖子力、谢楠子、刘阳、陆宇、王海峰，罗邦振
文章来源：王娟
摘要：糖尿病肾病（DN）是一种常见的糖尿病相关并发症，是进展性慢性肾脏病（CKD）的主要原因）和终末期肾病。尽管 DN 的治疗发展迅速，但目前用于早期 DN 的现有疗法无法预防进行性 CKD。确切的致病机制和潜在的分子事件g DN 的发展仍不清楚。人参皂苷 Rg3 是一种具有多种药理作用的草药。为了更好地了解人参皂苷Rg3在DN治疗中作用的分子机制和信号通路，采用RNA测序方法筛选人参皂苷Rg3治疗的DN大鼠模型中的差异基因表达，然后进行联合生物信息学分析旨在深入了解疾病发展的潜在分子机制，以确定治疗 DN 的潜在新靶点。 6只雄性Sprague-Dawley大鼠随机分为3组：正常对照组、DN组和人参皂苷-Rg3治疗组，每组2只。采用 RNA 测序对 DN 大鼠模型肾皮质细胞进行转录组分析。筛选出差异表达基因。聚类分析、基因本体论 (GO) 和京都基因和基因组百科全书 (KEGG) 丰富nt分析用于分析差异表达基因。与正常对照组相比，DN对照组总共鉴定出78个差异表达基因，其中52个基因上调，26个基因下调。与 DN 对照组相比，人参皂苷 Rg3 治疗组观察到 43 个基因表达差异，其中 10 个上调基因和 33 个下调基因。值得注意的是，与对照组相比，在 DN 对照组中表达下调的 21 种蛋白在人参皂苷 Rg3 治疗组中与 DN 对照组相比表达上调。此外，与对照组相比，DN 对照组中有 7 个上调的基因在人参皂苷 Rg3 治疗组中与 DN 对照组相比被下调。基于差异表达基因的聚类分析表明，样品之间的转录组差异较大。不同的 GO 术语关联这些基因组的作用被证明是富集的。 KEGG通路分析表明差异表达基因主要参与脂肪酸代谢通路和过氧化物酶体增殖物激活受体（PPAR）信号通路。据我们所知，这项研究首次通过 RNA-Seq 展示了经人参皂苷-Rg3 处理的 DN 的全基因组表达谱。鉴定了一组差异表达的基因和途径。这些数据让我们深入了解人参皂苷-Rg3 治疗 DN 的分子机制。