TEDDY 研究中早发 1 型糖尿病的人类肠道微生物组。
摘要来源：《自然》。 2018 年 10 月；562(7728):589-594。 Epub 2018 年 10 月 24 日。PMID：30356183
摘要作者：Tommi Vatanen、Eric A Franzosa、Randall Schwager、Surya Tripathi、Timothy D Arthur、Kendra Vehik、Åke Lernmark、William A Hagopian、Marian J Rewers、Jin-Xiong She、Jorma Toppari、Anette-G Ziegler、Beena Akolkar、Jeffrey P Krischer、Christopher J Stewart、Nadim J Ajami、Joseph F Petrosino、Dirk Gevers、Harri Lähdesmäki、Hera Vlamakis、Curtis Huttenhower、Ramnik J Xavier
文章隶属关系：Tommi Vatanen
摘要：1 型糖尿病 (T1D) 是一种自身免疫性疾病，以胰岛 β 细胞为靶标，涉及遗传和环境因素，包括复杂的遗传因素、患者暴露情况和肠道微生物组。病毒感染和更广泛的肠道菌群失调已被确定为潜在原因或促成因素；然而，人类研究尚未确定可预测胰岛自身免疫或 T1D 的微生物组成或功能触发因素。在这里，我们分析了 783 名非西班牙裔儿童粪便样本中的 10,913 个宏基因组，其中大部分是白人、非西班牙裔儿童。在青年糖尿病的环境决定因素 (TEDDY) 研究中，从三个月大到临床终点（胰岛自身免疫或 T1D），每月收集样本，以表征早期肠道微生物组与胰岛相关的自然历史。自身免疫、T1D 诊断以及其他常见的早期生活事件，例如抗生素治疗和益生菌。对照儿童的微生物组包含更多与发酵和短链脂肪酸生物合成相关的基因，但这些基因与地理不同的临床中心的特定分类群并不一致，这表明微生物因素与h T1D 在分类上是分散的，但在功能上更加一致。当我们研究婴儿微生物组的更广泛建立和发展时，分类学和功能特征都是动态的且高度个性化，并且在生命的第一年由三种基本上独有的双歧杆菌物种（B. bifidum、B. breve 或 B. breve）中的一种主导。 . longum）或变形菌门。特别是，在长双歧杆菌的一个子集中，用于利用人乳寡糖的基因的菌株特异性携带特别存在于母乳喂养的婴儿中。据我们所知，这些 TEDDY 肠道宏基因组的分析提供了与胰岛自身免疫、T1D 和其他儿童早期事件相关的发育中肠道微生物组的最大、最详细的纵向功能概况。结合人类队列和 T1D 小鼠模型的现有证据，这些数据支持短链脂肪酸对早发人类 T1D 的保护作用。