基于系统生物学和结构生物信息学方法研究 Georgi 对口腔鳞状细胞癌的治疗作用。
摘要来源：Biomed Res Int。 2024；2024：1236910。 Epub 2024 年 1 月 30 日。PMID：38322303
摘要作者：Zeynab Bayat、Tina Mazaheri、Homa Farhadifard、Amir Taherkhani
文章隶属关系：Zeynab Bayat
摘要：目的：口腔鳞状细胞癌 (OSCC) 是最常见的口腔癌，占所有口腔癌的 90% 以上。 OSCC患者的5年生存率并不令人满意，因此，除了现有的治疗方法之外，迫切需要新的实用治疗方法来克服OSCC。Georgi (SBG)是唇形科植物，具有多种药用特性，例如作为抗氧化剂、抗炎剂和抗癌作用。之前的研究已经证明了SBG对OSCC的疗效。
方法：采用系统生物学方法来识别差异表达与预后良好的 OSCC 患者相比，预后较差的 OSCC 患者中的 miRNA（DEM）。基于 DEM 目标构建蛋白质相互作用图 (PIM)，并指出 PIM 内的枢纽基因。随后，使用 Kaplan-Meier 曲线研究了中枢的预后作用。接下来，通过分子对接分析评估SBGs主要成分黄芩素、汉黄芩素、oroxylin-A、丹参素和去甲汉黄芩素与OSCC预后标志物的结合亲和力。
结果：生存分析显示，CAV1、SERPINE1、ACTB、SMAD3、HMGA2、MYC、EIF2S1、HSPA4、HSPA5 和 IL6 的过度表达与 OSCC 不良预后显着相关。是分子对接分析显示SBGs主要成分与SERPINE1、ACTB、HMGA2、EIF2S1、HSPA4、HSPA5之间的Δ和抑制常数值分别为<-8.00kcal/mol和纳摩尔浓度。汉黄芩素和 SERPINE1 之间观察到最显着的结合亲和力，标准为Δ<-10.02 kcal/mol。
结论：本研究结果基于系统生物学和结构生物信息学分析，揭示了 SBG 对 OSCC 治疗作用的潜在机制。