下一代测序揭示了用橄榄苦苷和油橄榄素处理的三阴性乳腺癌细胞中基因表达的改变和丰富的通路。
摘要来源:功能整合基因组学。 2023 年 9 月 14 日;23(4):299。 Epub 2023 年 9 月 14 日。PMID:37707691
摘要作者:Paraskevi Karousi、Christos K Kontos、Panagiota Papakotsi、Ioannis K Kostakis、Alexios-Leandros Skaltsounis、Andreas Scorilas
文章隶属关系:Paraskevi Karousi
摘要:三阴性乳腺癌(TNBC)是乳腺癌的一种亚型,其特点是预后差、治疗选择有限。橄榄苦甙和油橄榄甙是特级初榨橄榄油中发现的生物活性化学物质;它们已被证明具有抗癌作用潜力。在这项研究中,我们检查了这两种天然化合物对 MDA-MB-231 和 MDA-MB-468 TNBC 细胞系的抑制作用。将人 TNBC MDA-MB-231 和 MDA-MB-468 细胞系用不同浓度的橄榄苦苷或油橄榄素处理 48 小时。在确定达到 IC50 的最佳浓度后,使用磺基罗丹明 B 测定,在 12、24 和 48 小时后从处理和未处理的细胞中提取总 RNA。进行 Poly(A)-RNA 选择,然后进行文库构建和 RNA 测序。进行差异基因表达(DEG)分析以识别处理和未处理细胞之间的DEG。使用KEGG和GO数据库进行通路分析。橄榄苦苷和油橄榄苷显着降低了 TNBC 细胞的增殖,其中油橄榄苷的作用比橄榄苦苷稍强。此外,多时间序列RNA测序表明,TNBC细胞的表达谱在处理后显着改变。这些化合物的时间动态和基因组在所有时间点都受到一致的影响。通路分析揭示了与 TNBC 相关的几个重要通路,包括细胞死亡、凋亡过程、程序性细胞死亡、应激反应、有丝分裂细胞周期过程、细胞分裂和癌症进展。我们的研究结果表明,橄榄苦苷和油橄榄素对 TNBC 具有潜在的治疗益处,并且可以作为替代治疗方案进行进一步研究。