芹菜素对 TNFα 免疫激活的 MDA-MB-231 乳腺癌细胞的全转录组分析。
摘要来源：癌症基因组学蛋白质组学。 2019年11月-12月；16(6):421-431。 PMID：31659097
摘要作者：David Bauer、Elizabeth Mazzio、Karam F A Soliman
文章隶属关系：David Bauer
摘要：背景： 三阴性乳腺癌的分类是缺乏激素受体、抗雌激素或芳香酶抑制剂化疗无效以及非裔美国人人群死亡率较高。晚期乳腺肿瘤在整个肿瘤/基质环境中具有高浓度的肿瘤坏死因子-α (TNFα)，促使多种趋化因子（即 C-C 基序趋化因子配体 2 (CCL2)/CCL5）持续释放。这些有效的趋化因子随后可以直接引导 le 的大量渗透。核细胞亚群驻留在肿瘤内，引发肿瘤免疫监视的丧失以及随后的肿瘤快速生长。此前，我们证明在 MDA-MB-231 TNBC 细胞系中，TNFα 会引起免疫信号蛋白的增加：CCL2、粒细胞巨噬细胞集落刺激因子、白细胞介素 (IL)1α、IL6 和核因子 kappa-B 激酶抑制剂亚基 epsilon (IKBKε) 所有这些都被芹菜素减弱，芹菜素是洋甘菊和欧芹中发现的一种膳食类黄酮。
材料和方法：<目前的工作通过使用 Affymetrix Hugene-2.1_ST 人类微阵列检查整个转录组中的 mRNA 和长基因间非编码 RNA，阐明了在存在或不存在芹菜素的情况下 TNFα 引起的变化。对 48,226 个基因进行差异基因表达分析。
结果：TNFα 导致 75 个基因上调并下调10.O的调节其中，芹菜素有效下调了 TNFα 上调的 75 个基因中的 35 个。这些发现证实了我们之前的工作，特别是 IL1A 中 TNFα 诱发的峰值与未处理对照相比 [+21 倍变化 (FC)，p<0.0001] 在 TNFa 存在的情况下被芹菜素减弱（-15 FC 与 TNFα ，p<0.0001）。芹菜素介导的 TNFα 上调转录本的下调也有类似的趋势：IKBKE（TNFα：4.55 FC 与对照相比，p<0.001；TNFα 加芹菜素：-4.92 FC，p<0.001）、CCL2（2.19） FC，p<0.002；和 -2.12 FC，p<0.003）、IL6（3.25 FC，p<0.020；和 -2.85 FC，p<0.043）和 CSF2（TNFα +6.04 FC，p<0.001；和 -2.36 FC） ，p<0.007）。此外，这些数据进一步证实，芹菜素使以下转录本减少了 65% 以上，这些转录本也被 TNFα 上调：组织蛋白酶 S (CTSS)、补体 C3 (C3)、层粘连蛋白亚基 γ 2 (LAMC2)、(TLR2) )、Toll 样受体 2 G 蛋白偶联受体 C 类 5 成员 B (GPRC5B)、接触素相关蛋白1 (CNTNAP1)、密蛋白 1 (CLDN1)、活化 T 细胞核因子 2 (NFATC2)、C-X-C 基序趋化因子配体 10 (CXCL10)、CXCL11、白细胞介素 1 受体相关激酶 3 (IRAK3)、核受体亚家族 3 组C 成员 2 (NR3C2)、白细胞介素 32 (IL32)、IL24、狭缝引导配体 2 (SLIT2)、跨膜蛋白 132A (TMEM132A)、TMEM171、信号转导接头家族成员 2 (STAP2)、混合谱系激酶结构域样假激酶 (MLKL) ）、激酶插入结构域受体 (KDR)、BMP 结合内皮调节因子 (BMPER) 和 kelch 样家族成员 36 (KLHL36)。
结论：芹菜素可能具有下调与三阴性乳腺癌致瘤性白细胞亚群浸润相关的多种基因的治疗作用。这些数据已存入基因表达综合库以供公众分析，网址为：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE120550。