丁香提取物抗癌作用的综合数学模型研究()结合使用核磁共振波谱的代谢组学研究。
摘要来源:Iran J生物技术。 2020 年 7 月;18(3):e2336。 Epub 2020 年 7 月 1 日。PMID:33850939
摘要作者:Mehri Azadi、Fatemeh Alemi、Sedigheh Sadeghi、Maryam Mohammadi、Nowrooz Ali Rahimi、Sako Mirzaie、Farideh Vahabi、Shirin Parvaz、Mohammad Arjmand、Zahra Zamani
文章隶属关系:Mehri Azadi
摘要:背景:丁香油以其药用特性而闻名。使用 1H 核通过代谢组学在基因组规模上进行数学建模,研究了其抗癌特性的机制Raji 细胞的磁共振波谱。
目标:综合分析将 HNMR 鉴定的代谢物和基因与检测到的途径关联起来。
材料和方法:收集用丁香油处理的Raji细胞并送去进行HNMR波谱分析,并通过MATLAB和Human分析波谱用于代谢物鉴定的代谢组数据库。利用Metaboanalyst软件综合分析基因和代谢物进行通路和拓扑分析。
结果:50%抑制丁香油的浓度为 50μg/ml,模型预测了 74 个基因,其分化代谢物是一些氨基酸、胆固醇和岩藻糖。
结论:综合研究预测丁香油的抗癌机制涉及新的酶作为可能的药物靶点,胆固醇生物合成中的24-脱氢胆固醇还原酶和7-脱氢胆固醇还原酶,一碳代谢中的脱氢叶酸还原酶和鞘脂生物合成中的丝氨酸棕榈酰转移酶长链。