全转录组分析识别与疫苗接种后麻疹特异性抗体反应相关的 CD93 和其他浆细胞生存因子基因。
摘要来源:公共科学图书馆一号。 2016;11(8):e0160970。 Epub 2016 年 8 月 16 日。PMID:27529750
摘要作者:Iana H Haralambieva、Michael T Zimmermann、Inna G Ovsyannikova、Diane E Grill、Ann L Oberg、Richard B Kennedy、Gregory A Polish
文章隶属关系:Iana H Haralambieva
摘要:背景:没有足够的系统范围转录组(或其他)数据来帮助解释观察到的相互作用- 在健康个体中接种麻疹疫苗后抗体滴度的个体差异。
方法:我们对 30 例麻疹患者的 PBMC 进行体外病毒刺激后进行了转录组 (mRNA-Seq) 分析研究疫苗接种者是根据最高和最低抗体滴度从 764 名学童中选出的。我们使用回归和网络生物学模型来定义与中和抗体反应相关的标记。
结果:我们鉴定了 39 个差异表达基因证明高抗体反应组和低抗体反应组之间存在显着差异(p值≤0.0002,q值≤0.092),包括编码受体的顶级基因CD93(p<1.0E-13,q<1.0E-09)抗原驱动的 B 细胞分化、维持免疫球蛋白产生和保存骨髓中浆细胞所需的。网络生物学模型强调浆细胞存活(CD93、IL6、CXCL12)、趋化因子/细胞因子活性和细胞间通讯粘连/粘附/迁移作为与两个响应者组中观察到的差异反应相关的生物过程。
结论:我们确定部分解释并与麻疹疫苗接种后中和抗体滴度相关的基因和途径。这些新知识可以帮助识别保护性免疫的生物标志物和预测特征,这可能有助于设计新的候选疫苗和临床研究。